Ο δημοσιογράφιος πέθανε στις 13.20 στη Μονάδα Εντατικής Θεραπείας του Σισμανόγλειου Νοσοκομείου, όπου νοσηλευόταν εδώ και αρκετό καιρό με λοίμωξη του αναπνευστικού. Έπασχε από νεφρική ανεπάρκεια τελικού σταδίου. 

Σύμφωνα με το ιατρικό ανακοινωθέν του Νοσοκομείου, «σήμερα 3 Νοεμβρίου 2013, ημέρα Κυριακή και ώρα 13.20 απεβίωσε στην Μονάδα Εντατικής Θεραπείας του Νοσοκομείου μας ο δημοσιογράφος Γιάννης Καλαμίτσης, ετών 74, μετά από μακρά νοσηλεία λόγω λοίμωξης αναπνευστικού σε έδαφος νεφρικής ανεπάρκειας τελικού σταδίου».