Σε πεδίο αντιπαράθεσης μετατράπηκε η λειτουργία του PET SCAN στο ΠΑΓΝΗ μεταξύ του διοικητή του νοσοκομείου και της διευθύντριας του τμήματος. Αυξημένα κόστη επικαλείται η διοίκηση, ενώ  τις ακάλυπτες ανάγκες η υπεύθυνη για την λειτουργία τους μηχανήματος.

Την υποχρέωση έναντι των ασθενών και όχι τις δαπάνες του νοσοκομείου προκρίνει η διευθύντρια του τμήματος και υπεύθυνη για την λειτουργία του Pet Scan, Σοφία Κουκουράκη σε δηλώσεις της στο patris.gr. Σε μια μακρά περίοδο που η λειτουργία των νοσοκομείων της Κρήτης έχει ανάψει τα «αίματα» μια ακόμη αντιπαράθεση έρχεται να «δυναμιτίσει» περαιτέρω το κλίμα.  Ειδικότερα το κόστος, 1,5 εκατομμύριο ευρώ ετησίως,  που επιβαρύνει κατά πολύ τον νοσοκομειακό προϋπολογισμό με την απογευματινή λειτουργία του επικαλέστηκε ο διοικητής του νοσοκομείου, Γιώργος Χαλκιαδάκης. Από την  μεριά της απαντώντας στις δηλώσεις του διοικητή η καθηγήτρια πυρηνικής Ιατρικής Σοφία Κουκουράκη, υπενθύμισε ότι εκείνη δεσμεύεται από τον όρκο που έδωσε στον Ιπποκράτη και «όχι στο υπουργείο Οικονομικών». Επί του θέματος η κ. Κουκουράκη εφόσον δεν καλύπτονται οι ανάγκες και επιπλέον υπάρχει τέτοια επιβάρυνση του νοσοκομείου γιατί η διοίκηση υπέγραψε τη σύμβαση με το Υπουργείο και το Ίδρυμα Σταύρος  Νιάρχος. Μάλιστα, η κ. Κουκουράκη ζήτησε να ανακοινωθεί η οικονομοτεχνική μελέτη που επικαλέστηκε ο κ. Χαλκιαδάκης και από την οποία προκύπτει αυτό το κόστος για το νοσοκομείο. Ως υπεύθυνη για την λειτουργία του η κ. Κουκουράκη ισχυρίστηκε ότι εκείνη είναι γνώστης εάν διεξάγονται εξετάσεις, χωρίς ένδειξη. Αναγνωρίζοντας την προσπάθειά του για την επίλυση του προβλήματος, η καθηγήτρια υποστήριξε ότι πηγή του «κακού» είναι οι  απλήρωτες δαπάνες από τον ΕΟΔΥ.  Εφόσον η λειτουργία του μηχανήματος είναι τόσο ζημιογόνα, η καθηγήτρια προκάλεσε την διοίκηση να την σταματήσει.